Việt Nam thực hiện chức năng quản lý nhà nước:
+ Văn phòng.
+ Phòng Kế hoạch - Tài chính.
+ Phòng Quản lý đầu tư xây dựng và khai thác.
+ Phòng Pháp chế - Đấu thầu.
+ Phòng Khoa học công nghệ, Môi trường và Hợp tác quốc tế.
- Đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc Cục Đường cao tốc Việt Nam:
+ Trung tâm Kỹ thuật và Điều hành giao thông đường bộ