Tôi đang tìm hiểu văn bản mới về việc kiểm tra, xử lý kỷ luật trong thi hành xử lý vi phạm hành chính. Cho tôi hỏi trường hợp khi kiểm tra phát hiện có văn bản quy phạm pháp luật về xử lý vi phạm hành chính hoặc văn bản quy phạm pháp luật khác, có nội dung mẫu thuẫn với văn bản căn cứ thì cơ quan có thẩm quyền sẽ xử lý thế nào?